生态问题
为了防止小说低俗，正规的网络文学网站都有自己的敏感词库。可是，在正常的小说描写中，有时候作者避免不了描写一些爱情的场景，一篇小说中可能只有几百字。文学网站之间存在激烈的竞争，有时就会利用这一漏洞，相互举报对方涉及低俗。文学作品反而会劣币驱逐良币，有的小说开始游走在暧昧边缘，少数低俗的作品开始出现，影响整个网络生态。
抄袭问题
某一本网络小说火了之后，有一些作者就会跟风，写一部故事脉络差不多的小说。在这个过程中，很难界定是否存在抄袭，反而影响了原创作者的积极性。有一些网络作者，对是否抄袭的概念认知比较模糊，甚至存在有人觉得某些小说情节比较好，就“借鉴”过来，实际上与抄袭并无区别。
工作室转包问题
在网络小说市场，销售作品的时候，常见的是以工作室的方式进行。在小说创作初期，网站见到不错的作品，就会事先签约，作者边创作，网站边按时支付稿费，比如约定千字100元，有的工作室签约后，就以50元的价格转包出去，导致作品的质量大不如前，最终影响购买平台的利益。
行业盈利问题
网络文学作者和编辑的跳槽是常事，有的网络文学平台，好不容易培养了一个成熟作者，就被其他平台挖过去，造成不良竞争。有业内人士做了测算，网站支付作者千字100元的稿酬，至少需要3000人订阅小说。如果网站平台要覆盖成本，则需要5000人订阅，平台的运营成本很大。如今，IP销售很火，成为新的盈利点。如果保证平台获益，就需与作者签订“霸王条款”进行约束，导致双方分歧加大，增加跳槽几率，形成了恶性循环。
